RNA探針，是生物探針的一種，屬于核酸探針，是能與相對(duì)應(yīng)核酸序列進(jìn)行互補(bǔ)結(jié)合的一段核酸分子，根據(jù)來(lái)源來(lái)看，主要包括單鏈cDNA探針、cRNA探針、寡核苷酸探針三種。
　　RNA探針的核酸分子為單鏈，需經(jīng)過(guò)示蹤物標(biāo)記，然后與靶核酸序列進(jìn)行雜交，形成雙鏈，對(duì)標(biāo)記物進(jìn)行探測(cè)，可獲得樣品中是否含有目標(biāo)核酸序列，以及含量的多少與位置。RNA探針核酸分子的選擇需要關(guān)注核酸分子的特異性、制備與標(biāo)記難易程度、雜交穩(wěn)定性等，早期采用的RNA探針主要是細(xì)胞mRNA探針、病毒RNA探針，標(biāo)記難度較大，應(yīng)用受到限制。
　　目前常見(jiàn)的RNA探針細(xì)分產(chǎn)品中，單鏈cDNA探針，對(duì)相應(yīng)基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄，獲得mRNA，再經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄獲得cDNA，制備過(guò)程較為復(fù)雜；cRNA探針，以cDNA為模板，經(jīng)過(guò)體外轉(zhuǎn)錄獲得cRNA，制備難度較大；寡核苷酸探針，體外人工合成的與目標(biāo)基因序列互補(bǔ)的單鏈核苷酸片段，對(duì)片段長(zhǎng)度范圍要求較高，標(biāo)記物攜帶有限。這些不同類(lèi)型的RNA探針產(chǎn)品各有優(yōu)缺點(diǎn)。
　　RNA探針采用示蹤物進(jìn)行標(biāo)記，通常采用放射性同位素、地高辛、生物素、熒光染料等，這些示蹤物具有自顯影或者發(fā)光效果，以達(dá)到高靈敏檢測(cè)效果。例如以地高辛標(biāo)記的RNA探針為例，可以利用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)片段長(zhǎng)度，利用斑點(diǎn)雜交實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證探針靈敏度，雜交完成后標(biāo)記物檢測(cè)方便。
　　與DNA探針相比，RNA探針具有可改良雜交印跡、雜交反應(yīng)效率高的優(yōu)點(diǎn)，但僅能夠在體外轉(zhuǎn)錄過(guò)程中進(jìn)行標(biāo)記，且不穩(wěn)定容易被降解。因此RNA探針一般不應(yīng)用在檢測(cè)領(lǐng)域，主要應(yīng)用于科研領(lǐng)域。RNA探針可以廣泛應(yīng)用在動(dòng)物、植物、微生物、病毒等基因編輯研究領(lǐng)域，例如HIV病毒基因組DNA克隆研究方面。
　　在全球范圍內(nèi)，RNA探針提供商主要有瑞士Roche、荷蘭Biolegio、英國(guó)Bioline、美國(guó)Sigma-Aldrich、美國(guó)Empire Genomics、美國(guó)Bio-Techne、美國(guó)Promega、中國(guó)臺(tái)灣Abnova Corporation等，主要集中在美國(guó)地區(qū)，其次是歐洲地區(qū)。
　　我國(guó)科研實(shí)力不斷進(jìn)步，RNA探針作為重要工具，研究還在不斷深入。2024年3月，中國(guó)科學(xué)院大連化學(xué)物理研究所研究團(tuán)隊(duì)，發(fā)展了能夠與RNA特異性可逆結(jié)合，在活細(xì)胞內(nèi)對(duì)細(xì)胞核核仁穩(wěn)定成像的“緩沖熒光探針”Nu-AN，實(shí)現(xiàn)了對(duì)核仁動(dòng)態(tài)輪廓的成像。